Thế giới đang tụt hậu một cách nguy hiểm trong việc theo dõi sự xuất hiện của các biến thể COVID-19 mới do không thể mở rộng quy mô giải trình tự bộ gen của các trường hợp mới đủ nhanh để theo dõi vi rút đột biến. Tổ chức Chăm sóc sức khỏe AIDS (AHF) đang kêu gọi các quốc gia hợp tác và cam kết đạt được mục tiêu toàn cầu là xác định trình tự ít nhất 5% trong tất cả các trường hợp COVID-19 và báo cáo kết quả liên tục trong vòng một tuần.
Theo Sáng kiến toàn cầu về chia sẻ dữ liệu cúm gia cầm (GISAID), nền tảng toàn cầu truy cập mở lớn nhất theo dõi trình tự bộ gen của SARS-CoV-2, hiện chỉ có khoảng 1.5% trong số tất cả các trường hợp đã được giải trình tự và báo cáo cho GISAID. Trong khi một số quốc gia đang hoạt động tốt, chẳng hạn như Úc và Iceland đã xác định trình tự lần lượt là 58.6% và 57% trường hợp, thì hầu hết các quốc gia đều ở mức dưới 5%, bao gồm nhiều quốc gia công nghiệp hóa, phát triển. Tệ hơn nữa, hầu hết các báo cáo tiếp cận GISAID đều đã lỗi thời – trung bình, kể từ thời điểm dữ liệu được thu thập, các quốc gia phải mất gần 78 ngày để gửi dữ liệu đó cho GISAID. Với độ trễ báo cáo hơn 2.5 tháng, dữ liệu cũ này làm suy yếu nghiêm trọng các nỗ lực ứng phó với vi-rút thay đổi liên tục.
Chủ tịch AHF cho biết: “Việc giải trình tự bộ gen là cực kỳ quan trọng, bởi vì chúng ta có thể thấy bức tranh dịch tễ học phát triển với độ trễ đáng kể về thời gian – dữ liệu hiện có là ảnh chụp nhanh những gì đã xảy ra một tháng trước hoặc lâu hơn”. Michael weinstein. “Ví dụ, nếu một biến thể mới đang xuất hiện ngay bây giờ ở Jamaica, Peru hoặc Ukraine, chúng tôi sẽ không biết về nó cho đến tháng sau. Đây là vấn đề an ninh y tế toàn cầu và Hoa Kỳ có thể đóng vai trò lãnh đạo quan trọng trong giải trình tự bộ gen bằng cách đẩy mạnh những nỗ lực này trong nước và cũng giúp các quốc gia khác làm như vậy. Nếu không có dữ liệu giải trình tự bộ gen toàn cầu kịp thời, chúng ta đang mù quáng và chiến đấu trong cuộc chiến của ngày hôm qua.”
AHF đã bắt đầu tài trợ cho các dự án giải trình tự bộ gen thông qua Viện Y tế Công cộng Toàn cầu tại Đại học Miami như một cách để chứng minh làm thế nào một mô hình như vậy có thể được triển khai nhanh chóng và hiệu quả. Kể từ khi ra mắt vào đầu năm nay, sáng kiến này đã mở rộng ra ngoài Miami. Đáp lại yêu cầu đề xuất về giải trình tự bộ gen, AHF đã nhận được các bản đệ trình từ Mexico, Argentina, Brazil, Uganda, Kenya, Ấn Độ, Trinidad & Tobago và Thái Lan, cũng như các biểu hiện quan tâm từ Jamaica, Philippines và Ukraine.
“Chúng tôi đang tài trợ cho các dự án giải trình tự bộ gen như một cách để chứng tỏ rằng chúng tôi không chỉ nói về nó và yêu cầu nhiều hành động hơn mà còn thực hiện nó. Một trong những yêu cầu đối với các khoản tài trợ do AHF tài trợ là dữ liệu phải được chia sẻ với GISAID để mọi người trên khắp thế giới có thể hưởng lợi từ kiến thức này,” ông cho biết Tiến sĩ Jorge Saavedra, Giám đốc Điều hành của Viện Y tế Công cộng Toàn cầu AHF tại Đại học Miami.
Giáo sư Mario Stevenson, một nhà virus học nổi tiếng của Đại học Miami và là một trong những người nhận được trợ cấp AHF đã mô tả tầm quan trọng của việc theo dõi các biến thể SARS-CoV-2 mới nổi như một cách để biết kẻ thù của một người. “Cách tốt nhất để chống lại kẻ thù là biết kẻ thù từ bên trong. Giải trình tự bộ gen cho phép chúng tôi biết chính xác cách thức virus corona thay đổi, nó có khả năng tiến hóa và tấn công như thế nào, và liệu đó là một biến thể đáng lo ngại hay một biến thể đáng quan tâm cần được theo dõi chặt chẽ,” Giáo sư Stevenson cho biết.
